Sylvie Hamel
- Directrice de département
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
- Professeure titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
André-Aisenstadt office 3161
Courriels
hamelsyl@iro.umontreal.ca (Travail)
Web : ResearchGate
Web : Autre site web
Affiliations
- Responsable – LBIT — Laboratoire de biologie informatique et théorique
- Membre – CRM — Centre de recherches mathématiques
Education Programs
- PhD in Biochemistry – Fundamental and Applied Sciences Health Sciences Life Sciences
- Fundamental and Applied Sciences Health Sciences Life Sciences
Courses
- BCM70522 Communication scientifique avancée 2.2
- BIN70062 Communication scientifique avancée 3.2
Areas of Expertise
Student supervision Expand all Collapse all
HarmonyCo : développement d'une bibliothèque Python pour le calcul optimisé de la médiane de permutations
Thèses et mémoires dirigés
/
2024
-
2024
Graduate : Rabah, Ahmed Imed Eddine
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Combinaison de différents scores génétiques pour mieux évaluer l’impact des CNV sur la cognition
Thèses et mémoires dirigés
/
2022
-
2022
Étude algorithmique et combinatoire de la méthode de Kemeny-Young et du consensus de classements
Thèses et mémoires dirigés
/
2019
-
2019
Étude combinatoire et algorithmique de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Thèses et mémoires dirigés
/
2019
-
2019
Étude de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Thèses et mémoires dirigés
/
2016
-
2016
Analysing artefacts dependencies to evolving software systems
Thèses et mémoires dirigés
/
2014
-
2014
Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle
Thèses et mémoires dirigés
/
2013
-
2013
Evaluating Design Decay during Software Evolution
Thèses et mémoires dirigés
/
2013
-
2013
Modeling protein evolution using secondary structures
Thèses et mémoires dirigés
/
2011
-
2011
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
Thèses et mémoires dirigés
/
2011
-
2011
Graduate : Benoit Bouvrette, Louis Philip
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Algorithmes pour la réconciliation d’un arbre de gènes avec un arbre d’espèces
Thèses et mémoires dirigés
/
2010
-
2010
Helix Explorer : une nouvelle base de données de structures de protéines
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
Graduate : Tikah Marrakchi, Mohamed
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
De nouveaux algorithmes de tri par transpositions
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
Parcours de parents immigrants dont le fils a fait l'expérience d'un gang de rue et d'une institutionnalisation : vécu familial bouleversé
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
Algorithme de comparaison de structures secondaires d'ARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2006
-
2006
L'intervention face au phénomène des gangs : l'exemple du Centre jeunesse de Montréal - Institut universitaire
Thèses et mémoires dirigés
/
2006
-
2006
Application d'algorithmes de bio-informatique à la recherche de patrons de conception
Thèses et mémoires dirigés
/
2006
-
2006
Research projects Expand all Collapse all
Centre de recherches mathématiques (CRM) Projet de recherche au Canada / 2022 - 2029
Lead researcher :
Octavian Cornea
Co-researchers :
Yoshua Bengio
,
François Lalonde
,
Gilles Brassard
,
Michel Delfour
,
Marlène Frigon
,
Véronique Hussin
,
Christiane Rousseau
,
Jacques Bélair
,
Paul M Gauthier
,
Sabin Lessard
,
Alain Vinet
,
Nadia El-Mabrouk
,
Gena Hahn
,
Christian Léger
,
Fahima Nekka
,
Iosif Polterovich
,
Yvan Saint Aubin
,
Andrew Granville
,
Sylvie Hamel
,
Manuel Morales
,
François Perron
,
Mylène Bédard
,
Pierre Duchesne
,
Matilde Lalin
,
Robert Gwyn Owens
,
Manu Paranjape
,
Dana Schlomiuk
,
Luc Vinet
,
Mireille Schnitzer
,
Karim Jerbi
,
Alexander Fribergh
,
Alejandro Murua
,
Maciej Augustyniak
,
Benoît Mâsse
,
Dimitrios Koukoulopoulos
,
Jun Li
,
Benjamin Seamone
,
William Witczak-Krempa
,
Egor Shelukhin
,
Morgan Craig
,
Guillaume Lajoie
,
Margarida Carvalho
,
Guy Wolf
,
Florian Maire
,
Frédéric Dupont-Dupuis
,
Michael C. Mackey
,
Frédéric Lesage
,
Russell Steele
,
Erica Moodie
,
Paul François
,
Henri Darmon
,
Maxime Descoteaux
,
Prakash Panangaden
,
André Dieter Bandrauk
,
Peter Bartello
,
Chantal David
,
Jean-Marc Lina
,
Anthony Raymond Humphries
,
John P. Harnad
,
Jacques Claude Hurtubise
,
Pengfei Guan
,
John A Toth
,
Niky Kamran
,
Adrian Iovita
,
Eyal Goren
,
Dmitry Jakobson
,
Vojkan Jaksic
,
Daniel Tzvi Wise
,
André Garon
,
Éric P. Marchand
,
Debbie Janice Dupuis
,
Yogendra Chaubey
,
Pawel Gora
,
Hershy Kisilevsky
,
Galia Dafni
,
D. Korotkin
,
Marco Bertola
,
Alina Stancu
,
Lea Popovic
,
Ibrahim Assem
,
Tomasz Kaczynski
,
Shiping Liu
,
Vasilisa Shramchenko
,
Bruno L. Rémillard
,
Richard Fournier
,
Alfred Michel Grundland
,
David Stephens
,
Xiaowen Chang
,
Frederic Guichard
,
Erik P. Cook
,
Robert Brandenberger
,
Adrian Vetta
,
Keshav Dasgupta
,
Christophe Grova
,
Gantumur Tsogtgerel
,
Johanna Neslehova
,
Jean-Christophe Nave
,
Anmar Khadra
,
Adam M. Oberman
,
Michael Yves Michel Pichot
,
Alexander Maloney
,
Dana Louigi Addario-Berry
,
José Garrido
,
Alexei Kokotov
,
Wei Sun
,
Patrice Gaillardetz
,
Linan Chen
,
Piotr Przytycki
,
Vladimir Makarenkov
,
Louis-Paul Rivest
,
François Bergeron
,
Steven P. Boyer
,
Line Baribeau
,
Frédéric Gourdeau
,
Claude Levesque
,
Thomas Joseph Ransford
,
Jean-Marie De Koninck
,
Javad Mashreghi
,
Thierry Duchesne
,
Srecko Brlek
,
Christophe Reutenauer
,
Vestislav Apostolov
,
Steven Lu
,
Geneviève Lefebvre
,
Hélène Cossette
,
Étienne Marceau
,
José Manuel Urquiza
,
Hugo Chapdelaine
,
Michael Lau
,
Alexandre Girouard
,
Antonio Lei
,
Jean-François Renaud
,
Christophe Hohlweg
,
Mathieu Boudreault
,
FRANCO SALIOLA
,
Alexandre Roch
,
Frédéric Rochon
,
Alexandre Blondin-Massé
,
Clement Hyvrier
,
Denis Talbot
,
Alexandre Bureau
,
Fabrice Larribe
,
Aurélie Labbe
,
Cody Hyndman
,
Khader Khadraoui
,
Hamed Hatami
,
Roger Villemaire
,
Frédéric Godin
,
Marcin Sabok
,
Yi Yang
,
Anne Mackay
,
Jérôme Vétois
,
Ting-Huei Chen
,
Habib Benali
,
Taoufik Bouezmani
,
Christian Genest
,
Xiaowen Zhou
,
Sorana Froda
,
Mélina Mailhot
,
Alexandra Schmidt
,
Simon Philippe Caron-Huot
,
Abdoulaye Banire Diallo
,
Jean-Philippe Lessard
,
Sarah Harrison
,
Anne-Sophie Charest
,
Masoud Asgharian-Dastenael
,
Rustum Choksi
,
Abbas Khalili Mahmoudabadi
,
Simon Gravel
,
Arusharka Sen
,
Arthur Charpentier
,
Mathieu Pigeon
,
Benoit Larose
,
Thomas Brüstle
,
Laurent Charlin
,
Janosch Ortmann
,
Tim Hoheisel
,
Jean Deteix
,
Jessica Lin
,
Michael Lipnowski
,
Giovanni Rosso
,
Thomas Hugh
,
Jean-Philippe Burelle
,
Julien Keller
,
Félix Camirand Lemyre
,
Marie-Pier Côté
,
Damir Kinzebulatov
,
Duncan McCoy
,
Klaus Herrmann
,
Felix Kwok
,
Courtney Paquette
,
Anush Tserunyan
,
Suresh Krishna
,
Valentino Tosatti
,
Patrick Brodie Allen
,
Behrooz Yousefzadeh
,
Marc-Hubert Nicole
,
Rober Platt
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics. Projet de recherche au Canada / 2016 - 2024
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
FGR CRSNG en lien avec RN000686 Projet de recherche au Canada / 2021 - 2023
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-FGR - Subvention de recherche institutionnelle
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM) Projet de recherche au Canada / 2015 - 2023
Co-researchers :
Yoshua Bengio
,
François Lalonde
,
Gilles Brassard
,
Michel Delfour
,
Marlène Frigon
,
Véronique Hussin
,
Christiane Rousseau
,
Pavel Winternitz
,
Jacques Bélair
,
Paul M Gauthier
,
Sabin Lessard
,
Alain Vinet
,
Nadia El-Mabrouk
,
Fahima Nekka
,
Jiri Patera
,
Iosif Polterovich
,
Yvan Saint Aubin
,
Andrew Granville
,
Sylvie Hamel
,
Manuel Morales
,
François Perron
,
Pierre Duchesne
,
Matilde Lalin
,
Robert Gwyn Owens
,
Manu Paranjape
,
Alfred Michel Grundland
,
Mireille Schnitzer
,
Karim Jerbi
,
Alexander Fribergh
,
Alejandro Murua
,
Maciej Augustyniak
,
Louis-Pierre Arguin
,
Dimitrios Koukoulopoulos
,
Jun Li
,
Benjamin Seamone
,
William Witczak-Krempa
,
Laurent Charlin
,
Dominique Pelletier
,
Michael C. Mackey
,
Frédéric Lesage
,
Russell Steele
,
Erica Moodie
,
Paul François
,
Henri Darmon
,
Maxime Descoteaux
,
Prakash Panangaden
,
André Dieter Bandrauk
,
Peter Bartello
,
Chantal David
,
Jean-Marc Lina
,
Johannes Walcher
,
Anthony Raymond Humphries
,
John P. Harnad
,
Jacques Claude Hurtubise
,
Pengfei Guan
,
John A Toth
,
Karl Peter Russell
,
Niky Kamran
,
Adrian Iovita
,
Eyal Goren
,
Dmitry Jakobson
,
Vojkan Jaksic
,
Daniel Tzvi Wise
,
André Garon
,
Éric P. Marchand
,
Debbie Janice Dupuis
,
Syed Ali
,
Yogendra Chaubey
,
Christopher Cummins
,
Pawel Gora
,
Hershy Kisilevsky
,
Galia Dafni
,
D. Korotkin
,
Benoit Larose
,
Marco Bertola
,
Alina Stancu
,
Lea Popovic
,
Ibrahim Assem
,
Tomasz Kaczynski
,
Shiping Liu
,
Virginie Charette
,
Vasilisa Shramchenko
,
Bruno L. Rémillard
,
Thomas Brüstle
,
Richard Fournier
,
David Stephens
,
Xiaowen Chang
,
Frederic Guichard
,
Erik P. Cook
,
Robert Brandenberger
,
Adrian Vetta
,
Keshav Dasgupta
,
Christophe Grova
,
Bruce Shepherd
,
Gantumur Tsogtgerel
,
Johanna Neslehova
,
Jean-Christophe Nave
,
Anmar Khadra
,
Adam M. Oberman
,
Michael Yves Michel Pichot
,
Alexander Maloney
,
Dana Louigi Addario-Berry
,
Eusebius Jacobus Doedel
,
José Garrido
,
Richard Hall
,
Alexei Kokotov
,
Wei Sun
,
Patrice Gaillardetz
,
Linan Chen
,
Payman Kassaei
,
Piotr Przytycki
,
André Fortin
,
Louis-Paul Rivest
,
François Bergeron
,
Steven P. Boyer
,
Frédéric Gourdeau
,
Claude Levesque
,
Pierre Mathieu
,
Thomas Joseph Ransford
,
Jean-Marie De Koninck
,
Javad Mashreghi
,
Thierry Duchesne
,
Srecko Brlek
,
Christophe Reutenauer
,
Vestislav Apostolov
,
Steven Lu
,
Geneviève Lefebvre
,
Pedro Peres-Neto
,
Hélène Cossette
,
Étienne Marceau
,
José Manuel Urquiza
,
Hugo Chapdelaine
,
Michael Lau
,
Alexandre Girouard
,
Antonio Lei
,
Anne Bergeron
,
Jean-François Renaud
,
Christophe Hohlweg
,
Mathieu Boudreault
,
FRANCO SALIOLA
,
Alexandre Roch
,
Frédéric Rochon
,
Mark Powell
,
Alexandre Blondin-Massé
,
Clement Hyvrier
,
Denis Talbot
,
Alexandre Bureau
,
M'Hamed Lajmi Lakhal Chaieb
,
Karim Oualkacha
,
Aurélie Labbe
,
Cody Hyndman
,
Khader Khadraoui
,
Hamed Hatami
,
Roger Villemaire
,
Jean-François Coeurjolly
,
Frédéric Godin
,
Marcin Sabok
,
Yi Yang
,
Anne Mackay
,
Paramita Saha Chaudhuri
,
Jérôme Vétois
,
Ting-Huei Chen
,
Christian Genest
,
Xiaowen Zhou
,
Sorana Froda
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
Supplément COVID-19 CRSNG_Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics. Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS Projet de recherche au Canada / 2003 - 2017
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
Réseau Franco-Québécois de recherche sur l'ARN Projet de recherche au Canada / 2015 - 2016
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Co-researchers :
Jérôme Waldispuhl
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(FQ) Dévelop. de partenariats stratégiques en matière d'enseignement et de recherche (CFQCU)
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM) Projet de recherche au Canada / 2008 - 2016
Lead researcher :
Luc Vinet
Co-researchers :
Yoshua Bengio
,
François Lalonde
,
Gilles Brassard
,
Michel Delfour
,
Marlène Frigon
,
Véronique Hussin
,
Christiane Rousseau
,
Pavel Winternitz
,
Jacques Bélair
,
Anne Bourlioux
,
Paul M Gauthier
,
Sabin Lessard
,
Jean-François Angers
,
Abraham Broer
,
Nadia El-Mabrouk
,
Gena Hahn
,
Christian Léger
,
Fahima Nekka
,
Jiri Patera
,
Iosif Polterovich
,
Yvan Saint Aubin
,
Andrew Granville
,
Sylvie Hamel
,
Manuel Morales
,
François Perron
,
Octavian Cornea
,
Pierre Duchesne
,
Robert Gwyn Owens
,
Manu Paranjape
,
Jonathan Taylor
,
Michael C. Mackey
,
Frédéric Lesage
,
Erica Moodie
,
Henri Darmon
,
Maxime Descoteaux
,
André Dieter Bandrauk
,
Peter Bartello
,
Chantal David
,
Jean-Marc Lina
,
Johannes Walcher
,
Anthony Raymond Humphries
,
John P. Harnad
,
Jacques Claude Hurtubise
,
Pengfei Guan
,
David Avis
,
James Owen Ramsay
,
John A Toth
,
Sherwin A Maslowe
,
David B Wolfson
,
Karl Peter Russell
,
Olga Kharlampovich
,
Niky Kamran
,
Adrian Iovita
,
Eyal Goren
,
Dmitry Jakobson
,
Alain C. Vandal
,
Vojkan Jaksic
,
Daniel Tzvi Wise
,
Alexei Miasnikov
,
Thomas Wihler
,
Robert Seiringer
,
André Garon
,
John Mullins
,
Éric P. Marchand
,
Debbie Janice Dupuis
,
Syed Ali
,
Yogendra Chaubey
,
Christopher Cummins
,
Pawel Gora
,
Hershy Kisilevsky
,
John McKay
,
Galia Dafni
,
D. Korotkin
,
Benoit Larose
,
Marco Bertola
,
Vasek Chvatal
,
Alexander Shnirelman
,
Alina Stancu
,
Lea Popovic
,
Ibrahim Assem
,
Tomasz Kaczynski
,
Shiping Liu
,
Virginie Charette
,
Vasilisa Shramchenko
,
Bruno L. Rémillard
,
Yinannis Petridis
,
David Sankoff
,
Thomas Brüstle
,
Habib Benali
,
Nantel Bergeron
,
Simon Chauve
,
Francis Clarke
,
Richard Fournier
,
Martin Jakob Gander
,
Nadia Ghazzali
,
Alfred Michel Grundland
,
André Fortin
,
Louis-Paul Rivest
,
Christian Genest
,
François Bergeron
,
Steven P. Boyer
,
Line Baribeau
,
Frédéric Gourdeau
,
Robert Guénette
,
Claude Levesque
,
Pierre Mathieu
,
Thomas Joseph Ransford
,
Jean-Marie De Koninck
,
Javad Mashreghi
,
Thierry Duchesne
,
Srecko Brlek
,
André Joyal
,
Brenda MacGibbon
,
Christophe Reutenauer
,
Vestislav Apostolov
,
Olivier Collin
,
Steven Lu
,
Elisa Shahbazia Ohannessian
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS Projet de recherche au Canada / 2011 - 2015
Lead researcher :
Sylvie Hamel
Additional Information
Media
News
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