François Major
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
Pavillon Marcelle-Coutu office 3306-11
- Professeur accrédité
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Télécopieur : 514 343-5834
Web : ResearchGate
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Web : Autre site web
Affiliations
- Responsable – LBIT — Laboratoire de biologie informatique et théorique
- Membre – IRIC — Institut de recherche en immunologie et en cancérologie de l’Université de Montréal
- Membre – Centre Robert-Cedergren de l’Université de Montréal
Education Programs
- Environment and Sustainable Development Humanities Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences Information and Communication Technologies
- Fundamental and Applied Sciences Information and Communication Technologies
- Fundamental and Applied Sciences Information and Communication Technologies
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences
- Fundamental and Applied Sciences Social Sciences Arts and Music Literature and Languages
- Humanities Social Sciences
- Fundamental and Applied Sciences Health Sciences Life Sciences
- Fundamental and Applied Sciences Health Sciences Life Sciences
- University Preparatory Programs
- Fundamental and Applied Sciences Information and Communication Technologies
- Fundamental and Applied Sciences Health Sciences Life Sciences
Courses
- BIN6001 Algorithmes en bio-informatique moléculaire
- IFT1025 Programmation 2
- IFT2015 Structures de données
- IFT6292 Bio-informatique moléculaire
Areas of Expertise
- Bioinformatics
- Genomics
- Data structures
- Model Building
- DNA and RNA Chips
- COVID-19
- COVID19
Student supervision Expand all Collapse all
Predicting biomolecular function from 3D dynamics : sequence-sensitive coarse-grained elastic network model coupled to machine learning
Thèses et mémoires dirigés
/
2023
-
2023
Dissecting the effects of tumor microenvironment factors on cancer cells to reveal novel targets for multi-targeting RNA-based therapeutics
Thèses et mémoires dirigés
/
2023
-
2023
La reconnaissance automatique des brins complémentaires : leçons concernant les habiletés des algorithmes d'apprentissage automatique en repliement des acides ribonucléiques
Thèses et mémoires dirigés
/
2023
-
2023
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
Thèses et mémoires dirigés
/
2022
-
2022
Modélisation des réseaux de régulation de l’expression des gènes par les microARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2021
-
2021
Graduate : Poirier-Morency, Guillaume
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2020
-
2020
Graduate : Benoit Bouvrette, Louis Philip
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs
Thèses et mémoires dirigés
/
2019
-
2019
Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN.
Proposition d’un modèle basé sur la réactivité :
des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles.
Thèses et mémoires dirigés
/
2019
-
2019
Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2017
-
2017
Unfolding RNA 3D structures for secondary structure prediction benchmarking
Thèses et mémoires dirigés
/
2017
-
2017
Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam
Thèses et mémoires dirigés
/
2016
-
2016
Une signature du polymorphisme structural d’acides ribonucléiques non-codants permettant de comparer leurs niveaux d’activités biochimiques
Thèses et mémoires dirigés
/
2015
-
2015
Modélisation de réseaux d'interactions des microARN et analyse et validation expérimentale de leurs boucles minimales avec des facteurs de transcription
Thèses et mémoires dirigés
/
2013
-
2013
Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle
Thèses et mémoires dirigés
/
2013
-
2013
Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries
Thèses et mémoires dirigés
/
2012
-
2012
Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein
Thèses et mémoires dirigés
/
2011
-
2011
Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire
Thèses et mémoires dirigés
/
2011
-
2011
A new paradigm for the folding of ribonucleic acids
Thèses et mémoires dirigés
/
2010
-
2010
Prédiction structurale de biomolécules à l'aide d'une construction d'automates cellulaires simulant la dynamique moléculaire
Thèses et mémoires dirigés
/
2009
-
2009
Identification in silico d’éléments de réponse de récepteurs nucléaires impliqués dans le cancer du sein
Thèses et mémoires dirigés
/
2009
-
2009
Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires
Thèses et mémoires dirigés
/
2009
-
2009
Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes
Thèses et mémoires dirigés
/
2009
-
2009
Analyse de motifs d'ARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2008
-
2008
Approche plurielle à l'étude de la structure tertiaire de l'ARN chez les virus
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
MC-Map, un nouvel outil d'intégration de motifs
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
Un dictionnaire pour faciliter la recherche des gènes dans la littérature et sur Internet
Thèses et mémoires dirigés
/
2007
-
2007
Les feuillets beta dans les protéines : annotation, comparaison et construction
Thèses et mémoires dirigés
/
2005
-
2005
Prédiction des pré-miARN basée sur la conservation de structure dans les pri-miARN
Thèses et mémoires dirigés
/
2005
-
2005
Analyse des données d'expression de gènes
Thèses et mémoires dirigés
/
2005
-
2005
Prédiction de la structure commune aux ARN messagers codant pour la protéine STG
Thèses et mémoires dirigés
/
2005
-
2005
Modélisation tridimensionnelle des ARN par exploration de l'espace conformationnel et satisfaction de contraintes
Thèses et mémoires dirigés
/
2004
-
2004
Recherche de motifs structuraux dans les complexes acides ribonucléiques/protéines
Thèses et mémoires dirigés
/
2003
-
2003
Sélection d'oligonucléotides pour la fabrication de biopuces d'ADN
Thèses et mémoires dirigés
/
2002
-
2002
Modélisation automatisée de la structure 3-D des ARNs
Thèses et mémoires dirigés
/
2002
-
2002
Un algorithme génétique pour l'arrimage moléculaire
Thèses et mémoires dirigés
/
2002
-
2002
Étude de la structure des ARNm et des protéines impliqués dans les maladies neurodégénératives à prion
Thèses et mémoires dirigés
/
2001
-
2001
Définition d'une mesure de compatibilité séquence-structure dans les protéines à l'aide de modèles probabilistes graphiques et de réseaux de neurones artificiels
Thèses et mémoires dirigés
/
2001
-
2001
Détection et analyse de motifs structuraux et fonctionnels dans les acides ribonucléiques
Thèses et mémoires dirigés
/
2000
-
2000
Étude des environnements de microsimulation économique avec agents partiellement rationnels
Thèses et mémoires dirigés
/
1999
-
1999
Modélisation des boucles dans les protéines
Thèses et mémoires dirigés
/
1999
-
1999
Modélisation de la structure 3-D des ARN par satisfaction de contraintes
Thèses et mémoires dirigés
/
1999
-
1999
Phylogénétique basée sur les cassures du génome
Thèses et mémoires dirigés
/
1998
-
1998
Propriétés relationnelles tridimensionnelles des structures d'acides nucléiques
Thèses et mémoires dirigés
/
1998
-
1998
Research projects Expand all Collapse all
Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics Projet de recherche au Canada / 2020 - 2027
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
CECR_IRICoR_Integration of Multiple Algorithms into a Service Platform for Accurate and Precise Design and Structure Prediction of Coding and Non-Coding RNA Sequences Projet de recherche au Canada / 2023 - 2025
Co-researchers :
François Major
Funding sources:
Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Grant programs:
COMPUTATIONAL ANALYSIS AND MODELING OF NONCODING RIBONUCLEIC ACID STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 2014 - 2022
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
Supplément COVID-19 CRSNG_Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
Identifier le talon d’Achille du SARS-CoV-2 Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs:
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
Computation of cell-specific microRNA: Mrna rgulatory networks enables the design of efficient RNAi-based therapeutics Projet de recherche au Canada / 2016 - 2021
Lead researcher :
François Major
Co-researchers :
Thomas Duchaine
Funding sources:
Génome Canada
,
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
,
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE Projet de recherche au Canada / 2015 - 2020
Lead researcher :
Guy Sauvageau
Co-researchers :
Claude Perreault
,
Stephen Hanessian
,
Michel Bouvier
,
Trang Hoang
,
François Major
,
Denis-Claude Roy
,
Louis Gaboury
,
Sylvie Mader
,
Sylvain Meloche
,
Marc Therrien
,
Pierre Thibault
,
Katherine Borden
,
Jean-Claude Labbé
,
Alain Verreault
,
Julie Lessard
,
Jean Roy
,
Martine Raymond
,
Vincent Archambault
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Jean-Sébastien Delisle
,
Brian Wilhelm
,
Damien D'Amours
,
Philippe P. Roux
,
Josée Hébert
,
Julie Bergeron
,
Léa Harrington
,
Michael David Tyers
,
Grégoire Leclair
Funding sources:
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
PVXXXXXX-Fonds d'innovation
Programme de bourse d'été et d'initiation à la recherche au premier cycle IVADO. Candidat: Jorge Luis Flores / Discoverning the RNA structural determinants of the RNA-binding proteins Projet de recherche au Canada / 2018 - 2018
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs:
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
Deciphering and targeting the gene interaction networks that shape cancer cells Projet de recherche au Canada / 2015 - 2018
Lead researcher :
François Major
Co-researchers :
Étienne Gagnon
Funding sources:
SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs:
PVX12154-Subvention de fonctionnement
RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN Projet de recherche au Canada / 2013 - 2016
Lead researcher :
Jérôme Waldispuhl
Funding sources:
Centre/Coop.Interuni.Franco-Québéc/Fra
Grant programs:
COMPUTATIONAL PREDICTION OF RNA 3D STRUCTURE USING LOW RESOLUTION DATA AND A NEW RNA FOLDING ALGORITHM Projet de recherche au Canada / 2010 - 2016
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
METHODES INFORMATIQUE POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS Projet de recherche au Canada / 2011 - 2015
Lead researcher :
Jérôme Waldispuhl
Co-researchers :
François Major
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2015
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 1997 - 2015
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
METHODES INFORMATIQUES POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS Projet de recherche au Canada / 2011 - 2014
Lead researcher :
Jérôme Waldispuhl
Co-researchers :
François Major
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 2009 - 2013
Lead researcher :
François Major
RNA FOLDING AS A MEDIATOR OF STRESS RESPONSE IN PLANTS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2013
Lead researcher :
François Major
Funding sources:
International Human Frontier Science Program Organisation
Grant programs:
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS Projet de recherche au Canada / 2008 - 2013
Lead researcher :
François Major
DEVELOPING AND TESTING SMALL RNA-BASED MULTIPLE-TARGET GENE THERAPIES AGAINST CANCER AND AIDS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2012
Lead researcher :
François Major
TECHNOLOGICAL ADVANCES IN RNA THERAPY SYMPOSIUM Projet de recherche au Canada / 2011 - 2011
Lead researcher :
François Major
Recognition and Awards
- Prix Urgel-Archambault, Association francophone pour le savoir (Acfas), 2010.
Media
François Major est chercheur principal à l'IRIC
News
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