CONFÉRENCE RETROUVAILLE 2022

La bioinformatique a joué un rôle essentiel, depuis l'obtention des premières séquences de protéines, dans le décodage, l'analyse, la classification de l'information génétique et la compréhension des phénomènes biologiques sous-jacents. En parallèle, la découverte d'enzymes permettant de couper et coller des fragments spécifiques d'ADN a permis de modifier la structure génétique des organismes vivants, ce qui a donné naissance à l'industrie de la biotechnologie. En particulier, l'une des inventions majeures de ces dernières années est la technologie CRISPR-Cas9 issue d'un système immunitaire microbien permettant de lutter contre les virus. CRISPR-Cas9 est actuellement l'un des "ciseaux moléculaires" les plus fiables et les plus précis en biotechnologie. La bioinformatique a joué un rôle essentiel dans toutes les étapes de détection, d'analyse, de classification des systèmes CRISPR. Dans cette présentation, j'utiliserai ce système biologique comme exemple pour dresser un tableau des problématiques bioinformatiques sous-jacentes, et je parlerai notamment des méthodes algorithmiques développées dans mon laboratoire pour étudier l'évolution des modules de gènes Cas, par duplication, pertes et transferts horizontaux.

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