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François Major

Vcard
Professeur titulaire

Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle

Pavillon Marcelle-Coutu local 3306-11

francois.major@umontreal.ca

514 343-6752

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Télécopieur : 514 343-5834

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Biographie

François Major compte parmi les précurseurs de la bio-informatique. Alors qu’il entame ses études supérieures en informatique à l’Université de Montréal en 1984, il s’affaire à utiliser l’informatique pour répondre aux questions de la biologie. Son travail l’amène à développer un logiciel de modélisation tridimensionnelle des ARN sous la supervision de Robert Cedergren et de Guy Lapalme.

Après l’obtention de son diplôme de doctorat en 1990, le chercheur effectue un stage postdoctoral au NCBI sous la direction de David Lipman. L’Université de Montréal l’embauche en 1994 à titre de chercheur. En 2005, Francois Major est recruté par l’IRIC à titre de chercheur principal.

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Affiliations

  • Responsable – LBIT — Laboratoire de biologie informatique et théorique
  • Membre – IRIC — Institut de recherche en immunologie et en cancérologie de l’Université de Montréal
  • Membre – Centre Robert-Cedergren de l’Université de Montréal

Programmes d’enseignement

  • Baccalauréat en géographie environnementale – Sciences humaines Sciences pures et sciences appliquées Environnement et développement durable
  • Baccalauréat en informatique – Sciences pures et sciences appliquées Technologies de l'information (TIC)
  • Majeure en informatique – Sciences pures et sciences appliquées Technologies de l'information (TIC)
  • Mineure en informatique – Sciences pures et sciences appliquées Technologies de l'information (TIC)
  • Baccalauréat en mathématiques – Sciences pures et sciences appliquées
  • Majeure en mathématiques – Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en mathématiques et informatique – Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en mathématiques et informatique – Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en physique et informatique – Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en physique et informatique – Sciences pures et sciences appliquées
  • Baccalauréat en neuroscience cognitive – Sciences sociales Arts et musique Lettres et langues Sciences pures et sciences appliquées
  • Microprogramme de 1er cycle en analyse des mégadonnées en sciences humaines et sociales – Sciences humaines Sciences sociales
  • Baccalauréat en bio-informatique – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie
  • Baccalauréat en bio-informatique – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie
  • Programme d'accueil en sciences – Préparation aux études universitaires
  • Maîtrise en informatique – Sciences pures et sciences appliquées Technologies de l'information (TIC)
  • Maîtrise en bio-informatique – Sciences pures et sciences appliquées Sciences de la santé Sciences de la vie

Cours donnés

  • BIN6001 Algorithmes en bio-informatique moléculaire
  • IFT1025 Programmation 2
  • IFT2015 Structures de données
  • IFT6292 Bio-informatique moléculaire

Expertises

Approche bioinformatique pour la détermination et la prédiction de structure et fonction des ARN et des protéines (financement IRSC). Développement de méthodes pour la recherche et l'analyse de motifs structuraux dans les ARN (financement CRSNG). Approche bioinformatique pour la recherche et l'analyse des micro-ARN et des ARN d'interférence (financement stratégique CRSNG).

Encadrement Tout déplier Tout replier

Predicting biomolecular function from 3D dynamics : sequence-sensitive coarse-grained elastic network model coupled to machine learning Thèses et mémoires dirigés / 2023 - 2023
Diplômé(e) : Mailhot, Olivier
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Dissecting the effects of tumor microenvironment factors on cancer cells to reveal novel targets for multi-targeting RNA-based therapeutics Thèses et mémoires dirigés / 2023 - 2023
Diplômé(e) : Quenneville, Jordan
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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La reconnaissance automatique des brins complémentaires : leçons concernant les habiletés des algorithmes d'apprentissage automatique en repliement des acides ribonucléiques Thèses et mémoires dirigés / 2023 - 2023
Diplômé(e) : Chasles, Simon
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique Thèses et mémoires dirigés / 2022 - 2022
Diplômé(e) : Mola, Saraï
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Modélisation des réseaux de régulation de l’expression des gènes par les microARN Thèses et mémoires dirigés / 2021 - 2021
Diplômé(e) : Poirier-Morency, Guillaume
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN Thèses et mémoires dirigés / 2020 - 2020
Diplômé(e) : Benoit Bouvrette, Louis Philip
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs Thèses et mémoires dirigés / 2019 - 2019
Diplômé(e) : Yan, Yifei
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN. Proposition d’un modèle basé sur la réactivité : des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles. Thèses et mémoires dirigés / 2019 - 2019
Diplômé(e) : Malric, Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN Thèses et mémoires dirigés / 2017 - 2017
Diplômé(e) : Robitaille, Julie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Unfolding RNA 3D structures for secondary structure prediction benchmarking Thèses et mémoires dirigés / 2017 - 2017
Diplômé(e) : C-Parent, Gabriel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam Thèses et mémoires dirigés / 2016 - 2016
Diplômé(e) : El Korbi, Amell
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Une signature du polymorphisme structural d’acides ribonucléiques non-codants permettant de comparer leurs niveaux d’activités biochimiques Thèses et mémoires dirigés / 2015 - 2015
Diplômé(e) : Dallaire, Paul
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Modélisation de réseaux d'interactions des microARN et analyse et validation expérimentale de leurs boucles minimales avec des facteurs de transcription Thèses et mémoires dirigés / 2013 - 2013
Diplômé(e) : Lisi, Véronique
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle Thèses et mémoires dirigés / 2013 - 2013
Diplômé(e) : St-Onge, Karine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries Thèses et mémoires dirigés / 2012 - 2012
Diplômé(e) : Abella, Maria de los A.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein Thèses et mémoires dirigés / 2011 - 2011
Diplômé(e) : Boufaden, Asma
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire Thèses et mémoires dirigés / 2011 - 2011
Diplômé(e) : Fabre, Lucien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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A new paradigm for the folding of ribonucleic acids Thèses et mémoires dirigés / 2010 - 2010
Diplômé(e) : Parisien, Marc
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Prédiction structurale de biomolécules à l'aide d'une construction d'automates cellulaires simulant la dynamique moléculaire Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Caron, André
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Identification in silico d’éléments de réponse de récepteurs nucléaires impliqués dans le cancer du sein Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Laperrière, David
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Louis-Jeune, Caroline
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes Thèses et mémoires dirigés / 2009 - 2009
Diplômé(e) : Caron, Maxime
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Analyse de motifs d'ARN Thèses et mémoires dirigés / 2008 - 2008
Diplômé(e) : Lavoie, Louis-Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Approche plurielle à l'étude de la structure tertiaire de l'ARN chez les virus Thèses et mémoires dirigés / 2007 - 2007
Diplômé(e) : Permal, Emmanuelle
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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MC-Map, un nouvel outil d'intégration de motifs Thèses et mémoires dirigés / 2007 - 2007
Diplômé(e) : St-Onge, Nicolas
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Un dictionnaire pour faciliter la recherche des gènes dans la littérature et sur Internet Thèses et mémoires dirigés / 2007 - 2007
Diplômé(e) : Halawani, Amine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Les feuillets beta dans les protéines : annotation, comparaison et construction Thèses et mémoires dirigés / 2005 - 2005
Diplômé(e) : Parisien, Marc
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Prédiction des pré-miARN basée sur la conservation de structure dans les pri-miARN Thèses et mémoires dirigés / 2005 - 2005
Diplômé(e) : Tibiche, Chabane
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Analyse des données d'expression de gènes Thèses et mémoires dirigés / 2005 - 2005
Diplômé(e) : Paquet, Éric
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Prédiction de la structure commune aux ARN messagers codant pour la protéine STG Thèses et mémoires dirigés / 2005 - 2005
Diplômé(e) : Terbaoui, Ratiba
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Modélisation tridimensionnelle des ARN par exploration de l'espace conformationnel et satisfaction de contraintes Thèses et mémoires dirigés / 2004 - 2004
Diplômé(e) : Thibault, Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Recherche de motifs structuraux dans les complexes acides ribonucléiques/protéines Thèses et mémoires dirigés / 2003 - 2003
Diplômé(e) : Drapeau, Mathieu
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Sélection d'oligonucléotides pour la fabrication de biopuces d'ADN Thèses et mémoires dirigés / 2002 - 2002
Diplômé(e) : Dallaire, Paul
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Modélisation automatisée de la structure 3-D des ARNs Thèses et mémoires dirigés / 2002 - 2002
Diplômé(e) : Lemieux, Sébastien
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

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Un algorithme génétique pour l'arrimage moléculaire Thèses et mémoires dirigés / 2002 - 2002
Diplômé(e) : Levac, François
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Étude de la structure des ARNm et des protéines impliqués dans les maladies neurodégénératives à prion Thèses et mémoires dirigés / 2001 - 2001
Diplômé(e) : Barrette, Isabelle H.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Définition d'une mesure de compatibilité séquence-structure dans les protéines à l'aide de modèles probabilistes graphiques et de réseaux de neurones artificiels Thèses et mémoires dirigés / 2001 - 2001
Diplômé(e) : St-Arnaud, Daniel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Détection et analyse de motifs structuraux et fonctionnels dans les acides ribonucléiques Thèses et mémoires dirigés / 2000 - 2000
Diplômé(e) : Gendron, Patrick
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Étude des environnements de microsimulation économique avec agents partiellement rationnels Thèses et mémoires dirigés / 1999 - 1999
Diplômé(e) : Trussart, Vincent
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Modélisation des boucles dans les protéines Thèses et mémoires dirigés / 1999 - 1999
Diplômé(e) : Lefebvre, Sébastien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Modélisation de la structure 3-D des ARN par satisfaction de contraintes Thèses et mémoires dirigés / 1999 - 1999
Diplômé(e) : Lemieux, Sébastien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Phylogénétique basée sur les cassures du génome Thèses et mémoires dirigés / 1998 - 1998
Diplômé(e) : Blanchette, Mathieu
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Propriétés relationnelles tridimensionnelles des structures d'acides nucléiques Thèses et mémoires dirigés / 1998 - 1998
Diplômé(e) : Ftouhi, Abdelmjid
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

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Projets de recherche Tout déplier Tout replier

Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics Projet de recherche au Canada / 2020 - 2027

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

CECR_IRICoR_Integration of Multiple Algorithms into a Service Platform for Accurate and Precise Design and Structure Prediction of Coding and Non-Coding RNA Sequences Projet de recherche au Canada / 2023 - 2025

Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Programmes de subvention :

COMPUTATIONAL ANALYSIS AND MODELING OF NONCODING RIBONUCLEIC ACID STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 2014 - 2022

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

Supplément COVID-19 CRSNG_Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19

Identifier le talon d’Achille du SARS-CoV-2 Projet de recherche au Canada / 2020 - 2021

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche

Computation of cell-specific microRNA: Mrna rgulatory networks enables the design of efficient RNAi-based therapeutics Projet de recherche au Canada / 2016 - 2021

Chercheur principal : François Major
Co-chercheurs : Thomas Duchaine
Sources de financement : Génome Canada , IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech. , PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE Projet de recherche au Canada / 2015 - 2020

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Co-chercheurs : Claude Perreault , Stephen Hanessian , Michel Bouvier , Trang Hoang , François Major , Denis-Claude Roy , Louis Gaboury , Sylvie Mader , Sylvain Meloche , Marc Therrien , Pierre Thibault , Katherine Borden , Jean-Claude Labbé , Alain Verreault , Julie Lessard , Jean Roy , Martine Raymond , Vincent Archambault , Sébastien Lemieux , Anne Marinier , Jean-Sébastien Delisle , Brian Wilhelm , Damien D'Amours , Philippe P. Roux , Josée Hébert , Julie Bergeron , Léa Harrington , Michael David Tyers , Grégoire Leclair
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'innovation

Programme de bourse d'été et d'initiation à la recherche au premier cycle IVADO. Candidat: Jorge Luis Flores / Discoverning the RNA structural determinants of the RNA-binding proteins Projet de recherche au Canada / 2018 - 2018

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse

Deciphering and targeting the gene interaction networks that shape cancer cells Projet de recherche au Canada / 2015 - 2018

Chercheur principal : François Major
Co-chercheurs : Étienne Gagnon
Sources de financement : SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention : PVX12154-Subvention de fonctionnement

RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN Projet de recherche au Canada / 2013 - 2016

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major , Éric Lécuyer
Sources de financement : Centre/Coop.Interuni.Franco-Québéc/Fra
Programmes de subvention :

COMPUTATIONAL PREDICTION OF RNA 3D STRUCTURE USING LOW RESOLUTION DATA AND A NEW RNA FOLDING ALGORITHM Projet de recherche au Canada / 2010 - 2016

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :

METHODES INFORMATIQUE POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS Projet de recherche au Canada / 2011 - 2015

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2015

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 1997 - 2015

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

METHODES INFORMATIQUES POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS Projet de recherche au Canada / 2011 - 2014

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION Projet de recherche au Canada / 2009 - 2013

Chercheur principal : François Major

RNA FOLDING AS A MEDIATOR OF STRESS RESPONSE IN PLANTS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2013

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : International Human Frontier Science Program Organisation
Programmes de subvention :

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS Projet de recherche au Canada / 2008 - 2013

Chercheur principal : François Major

DEVELOPING AND TESTING SMALL RNA-BASED MULTIPLE-TARGET GENE THERAPIES AGAINST CANCER AND AIDS Projet de recherche au Canada / 2009 - 2012

Chercheur principal : François Major

TECHNOLOGICAL ADVANCES IN RNA THERAPY SYMPOSIUM Projet de recherche au Canada / 2011 - 2011

Chercheur principal : François Major

Prix et distinctions

  • Prix Urgel-Archambault, Association francophone pour le savoir (Acfas), 2010.

Médias

François Major est chercheur principal à l'IRIC

ARN, sport et rock'n roll

Chercheur, sportif et D.J., François Major met ses talents de programmeur informatique au service de la lutte contre le cancer. Avec son équipe, il travaille sur les acides ribonucléiques, mieux connu sous le nom de ARN. Il existe plusieurs familles d'ARN, mais ce sont les ARN messagers qui permettent à nos gènes de fabriquer les protéines nécessaires à la survie des cellules.

Nouvelles

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